Ang proyektong muling pagpapaunlad ay na-sponsor ng mga Espanyol na si Cruz y Ortiz, ang eksibisyon ay dinisenyo ni Jean-Michel Wilmotte, at ang pagpapanumbalik ay isinagawa ni Van Hoogevest Architecten. Ang gawain ng mga arkitekto ay upang iakma ang napakalaking gusali sa mainstream ng eclecticism, na itinayo noong 1885 ng Petrus (Pierre) Kuypers, para sa mga pangangailangan ng isang museyo ng ika-21 siglo. Ang mga luntiang interior ay nag-abala ng pansin mula sa mga eksibit, walang sapat na puwang para sa parehong mga eksibisyon at ang kasamang programa, imposibleng ayusin ang permanenteng eksibisyon ayon sa isang solong sistema, at iba pa.
Ngayon ang lahat ng mga exhibit mula ika-12 hanggang ika-20 siglo ay nakaayos sa isang mahigpit na pagkakasunud-sunod, ayon sa mga sahig mula sa ibaba hanggang sa itaas, at ang kronolohiya ay sinusuportahan ng isang scheme ng kulay: ang pintura sa mga dingding ay unti-unting lumiliwanag habang umaandar ito pataas, umaabot sa halos puti sa bulwagan ng modernong sining. Sa parehong oras, ang lahat ng mga gawa ay nakaayos sa isang bagong paraan, maliban sa pinakamahalaga - "Night Watch" ni Rembrandt, na bumalik sa dating lugar sa "Gallery of Honor", kung saan ang mga gawa ng Ginto Ipinakita ang edad ng sining ng Olandes.
Ang mga arkitekto, ayon sa naitatag na pamamaraan sa pagtatayo ng museo, ay hinarangan ang dalawang patyo ng gusali na may mga bubong na salamin, at pinalalim din ang mga ito sa antas ng -1 palapag, na naalis na dati ang mga susunod na extension na sumakop sa kanila. Pagkatapos ay naglagay sila ng isang awditoryum sa ilalim ng isang patyo, at isang museo shop at isang cafe sa ilalim ng isa pa. Ang mga patyo mismo ay naging maluwang na pampublikong puwang na maaaring ma-access kahit na hindi bumibili ng isang tiket. Ang kanilang mga dingding ang bumubuo sa mga harapan ng looban ng museyo, at ang mga bagong ibabaw ay nahaharap sa batong may kulay na ilaw. Sina Antonio Cruz at Antonio Ortiz ay isinasaalang-alang ang pagkakamali ni Norman Foster, na ang patyo ng British Museum ang anumang tunog ay malinaw na maririnig at maging ang mga pag-echo, kaya sa Rijksmuseum, ang mga ingay ay napapailing ng mga puting gratings na may tunog na humihigop ng tunog na nakasuspinde mula sa kisame.
Ngunit ang pangunahing problema para sa mga arkitekto ay ang pagsasama ng dalawang patyo sa isang solong buo. Ang makasaysayang gusali ay may isang pedestrian at siklista na pasilyo sa gitna ng harapan, na nagpapahintulot sa mabilis na daanan sa gusali. Ang proyektong muling pagtatayo ay naisip na gawing pangunahing pasukan sa museo, pinag-iisa ang parehong mga patyo, ngunit ang mga taong bayan ay naghimagsik, at ngayon ang koridor ay napanatili sa kanyang orihinal na form, ang museo ay maaaring ma-access sa pamamagitan ng apat na maliliit na pasukan, at isang daanan sa ilalim ng lupa ay inilatag sa ilalim nito, pagkonekta sa mga patyo sa bawat isa.
Ang museo ay sarado para sa muling pagtatayo noong 2003 at magbubukas na noong 2008. Ang 10-taong panahon ng trabaho ay ipinaliwanag ng katotohanan na ang mga pagsisikap na titanic ay kailangang gawin upang magtayo ng mga antas ng ilalim ng lupa sa puno ng tubig na lupa ng Amsterdam, at walang kontratista para sa isang kumplikadong proyekto. Ginawa ng mga inhinyero ng Arcadis ang bagong mga bahagi sa ilalim ng lupa ng gusali na istrukturang malaya mula sa istrakturang makasaysayang, habang dahan-dahang humupa. Samakatuwid, ang ground corridor at ang "Gallery of Honor" na matatagpuan sa itaas ng daanan sa ilalim ng lupa sa pagitan ng mga patyo ay ginawang isang "tulay" na nakabitin doon. Ang mga hukay na hinukay ay agad na napuno ng tubig, kaya't ibinuhos sila ng espesyal na kongkreto para sa gawaing sa ilalim ng tubig, at ang proseso ay kinontrol ng mga iba't iba.
Ang badyet ng proyekto ay 375 milyong euro, ngunit kasama rin dito ang pagtatayo ng isang hiwalay na pavilion ng sining ng Asya, na inilagay sa gitna ng pond, ang pagbagay ng parke sa isang eskultura na hardin ng proyekto ng Copijn Landschapsarchitecten (14,500 m2), ang pagtatayo ng isang gusali ng pasukan sa serbisyo, ang muling pagtatayo ng makasaysayang Paaralan ng Pagguhit (Teekenschool) bilang isang sentro ng pang-edukasyon ng museyo, pati na rin ang pagtatayo ng isang museyo na mga workshops na gusali malapit sa Rijksmuseum, nagsama sa isa pang gusali ng Kuypers - ang dating Institute para sa Kaligtasan at Kalusugan sa Trabaho.
Ngunit ang pagsasaayos ng museo ay hindi pa nakukumpleto: nanatili itong bukas para sa tagal ng muling pagtatayo
ang pakpak ng Philips ay gagawing isang modernong pansamantalang puwang ng eksibisyon. Ang mga may-akda ng proyekto ay si Cruz y Ortiz din.
