Ang institusyong ito ay nakatuon sa biodiversity bilang isang mahalagang tampok ng buhay sa Earth. Ang kayamanan ng kalikasan ng Panama ay gumagawa ng bansang ito ng isang perpektong lokasyon para sa isang museo.
Dinisenyo ni Frank Gehry, ang complex ay matatagpuan sa gitna ng isang malawak na parke, na binibigyang-diin ang pagkakaiba-iba ng mga flora at palahayupan ng Gitnang Amerika. Ito ay idinisenyo ng arkitektong landscape na si Edwina von Gal.
Ang mga pavilion ng museo ay maglalaman ng iba't ibang mga eksibit na magbibigay-daan sa bisita na lumapit sa kalikasan, kapwa literal at malambing. Si Bruce Mau ang responsable para sa disenyo ng eksibisyon.
Ang mga gusali ay tatakpan ng mga multi-kulay na bubong na makikita mula sa isang malayong distansya - na umaasa sa mga turista na darating sa lungsod sa mga cruise ship mula sa Karagatang Pasipiko.
Ang konstruksyon ay makukumpleto sa 2009.
